“东京决战”一年后，布里塔尼亚少年鲁路修在11区（原日本国）过着平凡的学生生活。但是，鲁路修与弟弟罗洛的一次出行，遇到了黑色骑士团的余党。在与少女C.C再次结成契约之后，尘封的记忆摆在了鲁路修的面前。　　身为帝国王子的鲁路修，为了建立人人平等的世界、让妹妹娜娜丽幸福的世界，而使用GEASS，令人绝对服从的力量，带领黑色骑士团向帝国宣战。带上假面化名ZERO的他，却在一年前的“东京决战”中被好友...

故事发生在静冈县沼津市海边的小镇、位於内浦的私立浦之星女子学院。在这间骏河湾一隅的小小高中里面，以2年级的高海千歌为中心的9名少女，怀抱著远大的梦想挺身而出。那就是，要成为闪闪发光的“学园偶像”！只要努力不懈梦想一定会实现──。现在只需要朝著那闪耀的目标，奋不顾身地勇往 直前就行了！ 从此，少女们“ 大家一起实现的故事”（学园偶像计划）就此展开！...